Дискретная модель генной сети циркулянтноготипа с пороговыми функциями | Вестник Томского государственного университета. Управление, вычислительная техника и информатика. 2008. № 2 (3).

ГлавнаяАрхивДискретная модель генной сети циркулянтноготипа с пороговыми функциями | Вестник Томского государственного университета. Управление, вычислительная техника и информатика. 2008. № 2 (3).

Дискретная модель генной сети циркулянтноготипа с пороговыми функциями

Рассматривается дискретная модель генных сетей, функционирование которых определяется заданием аддитивного автоматного отображения. Получено описание нового класса циклов и рабочих наборов моделей циклического типа, структура которых является циркулянтным ориентированным графом.

The Discrete Model of the Circulate Type GeneticNetwork with Threshold Function .pdf 1. Введение, основные определенияГенные сети служат основой для моделирования процессов, протекающих в клетке: поддерживают в организме устойчивые состояния, характеризующиеся постоянством концентрации веществ (стационарные состояния); обеспечивают периодические незатухающие колебания концентраций определенных групп веществ (циклы); контролируют необратимые процессы развития и роста [1].Контуры с положительными и отрицательными обратными связями обеспечивают управление генной сетью. Некоторые структурные особенности строения регуляторных контуров естественно формулируются в терминах ориентированных графов и дискретных моделей функционирования регуляторных контуров.-j^.Ниже рассматривается одна из таких моделей. Регуля-торный контур генной сети представляется в виде связ-^^^\ ного ориентированного графа G(V,D), где Vel,n -множество вершин, отождествляемое с продуктами ге-V нетических элементов (РНК, белки), а D - множество\ ^^

Ключевые слова

working vectors of a state graph , cycles of a state graph , state graph of a function , additive automata , digraph , Genetic network , циклы графа состояний , рабочие наборы графа состояний , аддитивный автомат , граф состояний отображения , ориентированный граф , генные сети

Авторы

ФИООрганизацияДополнительноE-mail
Евдокимов Александр Андреевич Институт математики им. С.Л. Соболева СО РАН профессор, кандидат физико-математических наук, зав. лабораторией дискретного анализа evdok@math.nsc.ru
Лиховидова Елена Олеговна Институт математики им. С.Л. Соболева СО РАН ведущий инженер leo13@gorodok.net
Всего: 2

Ссылки

Григоренко Е.Д., Евдокимов А.А., Лихошвай В.А., Лобарева И.А. Неподвижные точки и циклы автоматных отображений, моделирующих функционирование генных сетей // Вестник ТГУ. Приложение. 2005. № 14. C. 206 - 212.
Лихошвай В.А., Матушкин Ю.Г., Фадеев С.И. Задачи теории функционирования генных сетей // Сиб. журн. индустр. математики. 2003. Т. 6. № 2(14). С. 64 - 80.
Дискретная модель генной сети циркулянтноготипа с пороговыми функциями | Вестник Томского государственного университета. Управление, вычислительная техника и информатика. 2008. № 2 (3).

Дискретная модель генной сети циркулянтноготипа с пороговыми функциями | Вестник Томского государственного университета. Управление, вычислительная техника и информатика. 2008. № 2 (3).

Полнотекстовая версия