Современные подходы к моделированию разнообразия и пространственному распределению видов растений: перспективы их применения в России | Вестник Томского государственного университета. Биология. 2019. № 46. DOI: 10.17223/19988591/46/5

Современные подходы к моделированию разнообразия и пространственному распределению видов растений: перспективы их применения в России

Выполнен обзор научной литературы по современным методам моделирования видового богатства и пространственного распределения видов растений. Проведен анализ основных гипотез широтного градиента разнообразия растений - одной из наиболее обсуждаемых проблем изучения фиторазнообразия. Рассмотрены современные подходы к моделированию распространения видов растений с использованием различных программных средств. Подчеркивается важность использования достоверных данных и валидных методов моделирования для получения корректных результатов и прогнозов. Приведены, советы по реализации начальных исследований по моделированию. Рассмотрена возможность использования ранее опубликованных в России материалов по распространению видов растений в современных исследованиях. Отмечена низкая публикационная активность российских исследователей по обсуждаемой проблематике. В современных российских ботанических публикациях проявляется тенденция к активизации исследований по созданию баз данных, оцифровке гербарных фондов и публикации информации по распространению растений в свободном доступе.

Modern approaches to modeling plant diversity and spatial distribution of plant species: Implication prospects in Russia.pdf Введение Изучение формирования разнообразия биоты является давним и насущным вопросом биологии. Закономерности снижения видового богатства от экватора к полюсам всегда интересовали биологов и экологов со времен исследований Александра Гумбольдта, Альфреда Рассела Уоллеса и Чарльза Дарвина [1]. В последние годы проведены масштабные исследования по разнообразию животных, но при этом оценка ведущих факторов, определяющих закономерности распределения видового богатства растений, осталась наименее разработанной [2, 3]. Растительный покров является основой наземных экосистем, и вопросы изучения его разнообразия в мировом масштабе весьма актуальны. Современные подходы к моделированию разнообразия видов растений 83 Согласно исследованиям детерминирующими факторами видового богатства часто являются условия современного климата [4], долговременные климатические изменения [5], гетерогенность местообитаний [6], пространственные ограничения [7]. Из климатических факторов ключевыми являются параметры температуры и увлажнения, что было показано на примере многих таксонов и в различном масштабе [8, 9]. Гетерогенность местообитаний может оказывать влияние на видовое богатство за счет наличия большого числа экологических ниш и возможностей для диверсификации видов [6]. Вместе с тем фрагментация местообитаний, вызванная антропогенными нарушениями, может иметь больший эффект на сокращение числа видов в сравнении с процессами потепления климата [10]. Климатические флуктуации в четвертичном периоде также оказывали влияние на видовое богатство. Например, виды с низкой способностью к расселению приурочены к рефугиумам, где сохранялись стабильные климатические условия в периоды оледенений [5, 11]. Оценка широтных градиентов фиторазнообразия на глобальном уровне показала, что центры разнообразия наблюдаются в хорошо структурированных и геоэкологически разнородных территориях тропиков и субтропиков [12, 13]. Большая часть гипотез разнообразия видов протестирована с использованием данных из Северной Америки и Европы, в редких случаях с территории Азии. Отметим, что имеется ряд исследований на территории Китая и некоторых стран Юго-Восточной Азии, где выделены ключевые участки с высоким биоразнообразием (hot-spots) [14, 15]. Поэтому активизация исследований в этом направлении на территории России имеет первостепенное значение. В последние годы проводится все больше исследований по данной тематике, в основном работы зарубежных коллег. В итоге назрела необходимость публикации для российских биологов и экологов обзора по основным направлениям изучаемой проблемы, что будет в дальнейшем способствовать интеграции отечественных ботаников в международные исследования. В предлагаемом обзоре проведен анализ гипотез широтного градиента разнообразия видов растений, обозначены основные методы изучения пространственного распределения видов растений и моделирования их разнообразия, рассмотрены предпосылки для дальнейшего развития исследований по географии растений на территории России. Широтный градиент фиторазнообразия: основные гипотезы и ключевые положения Характеристика основных гипотез, используемых при изучении пространственных трендов разнообразия, хорошо представлена в публикации О.В. Морозовой [16]. В данном обзоре уделено внимание наиболее распространенному направлению исследований - широтному градиенту разнообразия (latitudinal diversity gradient) с привлечением современных публикаций. 84 Д.В. Санданов Оценка влияния широтного градиента на разнообразие видов (т.е. уменьшение видового богатства от экватора к полюсам) является одним из центральных вопросов биологии в течение последних двух столетий [17]. Все началось с обзорных работ Александра Гумбольдта, который первым начал обсуждать количественное изменение распределения видов по земному шару [18]. Помимо анализа общих закономерностей А. Гумбольдт предположил, что определяющими широтный градиент разнообразия являются характеристики климата (в частности зимние температуры), а также устойчивость растений к холодовому стрессу [17]. Первая предварительная количественная оценка разнообразия видов на земном шаре была проведена Е.В. Вульфом [18]. Подобные расчеты количественных показателей конкретных флор на широтном градиенте позднее были осуществлены для европейской части СССР [19], Восточной Европы [20] и Сибири [21]. Анализ методологии таких исследований и количественная оценка флористического разнообразия для территории Советского Союза проведены Л.И. Малышевым [22]. Гипотеза консервативности экологических ниш (постулирует, что близкородственные виды характеризуются сходными экологическими предпочтениями) оценивается как одна из наиболее значимых при оценке связей широтного градиента и разнообразия видов [23, 24]. Согласно этой гипотезе распространение видов тропического происхождения в процессе эволюции остается приуроченным к условиям тропического климата, как и в прошлые геологические эпохи. Поэтому наблюдается лишь небольшое число тропических видов, способных к распространению в другие климатические зоны вследствие сложной адаптации к условиям холодного климата [24, 25]. Это показывает, что зимние холода лимитируют распространение тропических видов в умеренную зону [26-28]. Виды, п^эиуроченные к умеренному поясу, имеют более широкие экологические предпочтения и поэтому могут встречаться в широких пределах, включая и тропическую зону, однако здесь они преимущественно встречаются на больших абсолютных высотах [15]. Необходимо также отметить, что современная умеренная зона была подвержена оледенению во время последнего ледникового максимума [5]. Доказано, что климатические флуктуации в четвертичном периоде способствовали утрате местообитаний, ограничивали распространение видов и привели к исчезновению некоторых из них, что в конечном итоге привело к утрате видового разнообразия в большом масштабе [29]. Несмотря на это горные регионы обеспечивали большое число климатических ниш и возможности для адаптации к различным местообитаниям [30] и могут рассматриваться как рефугиумы [31]. Палеореконструкции видового богатства древесных растений выявили, что после плиоцена вектор широтного градиента стал более явным [32]. Одной из интересных проблем экологии является оценка влияния современного климата на распространение растений с учетом их эволюционной истории. Эти исследования помогают понять, как эволюционная история видов и изменения климата в прошлом и настоящем определяют масштабные Современные подходы к моделированию разнообразия видов растений 85 закономерности видового разнообразия [23, 26, 33]. Одной из связанных с ними гипотез является гипотеза холодовой толерантности или тропического консерватизма, которая прогнозирует, что широтные градиенты видового разнообразия являются результатом комбинированного эффекта консерватизма экологических ниш, современного климата и динамики палеоклимата [15, 23, 26, 34]. Несмотря на наличие многочисленных исследований, вопросы эволюции взаимоотношений разнообразия видов и условий окружающей среды все еще остаются слабо раскрытыми [35]. Использование вышеуказанного подхода ограничивается трудностью оценки относительного вклада экологических и эволюционных процессов, а также недостаточностью достоверных данных по распространению видов и их эволюционной истории. Разные гипотезы затрагивают отдельные аспекты рассматриваемой проблемы, и ее решение возможно через сопряженный анализ всех возможных причин широтного градиента разнообразия [36]. Например, последние исследования показывают, что широтный градиент для древесных растений, мхов и печеночников может определяться кардинально различающимися вкладами и соотношением экологических предикторов [37]. Некоторые исследования не подтверждают наличие широтного градиента разнообразия или указывают на его асимметричность или разнонаправ-ленность трендов. Также отмечается, что варьирование трендов разнообразия биоты в основном происходит не с изменением широты, а вследствие изменения градиента среды: уменьшение разнообразия происходит в пес-симальных условиях. Так, изучение широтного градиента для позвоночных животных с использованием суррогатных шкал, основанных на вариабельности температурных значений, выявило его несоответствие в разных регионах и различном масштабе. Особые различия наблюдались в области Северного полушария [38]. Изучение распределения клавариоидных грибов на протяженной широтной трансекте (6 300 км от 20° до 80° с.ш.) также не показало уменьшения видового богатства, наибольшее разнообразие микобиоты наблюдалось в пределах 50°-60° с.ш. [39]. Тем не менее проведенный метаанализ с использованием огромной выборки (бактерии, простейшие, растения, грибы и животные) доказал наличие общего широтного градиента разнообразия [40]. Краткий обзор показывает, что проблематика, которая обсуждается биологами уже более 200 лет, еще далека от разрешения и поэтому необходимы новые данные и разработка методов для их комплексного анализа. Современные методы изучения пространственного распределения видов растений Принимая во внимание динамику климата и нарастающую антропогенную трансформацию растительного покрова планеты, на первый план сегодня выходят вопросы распространения видов, их прошлое и будущее, а 86 Д.В. Санданов также аспекты сохранения редких и исчезающих видов растений. С появлением новых методов и технологий появилась возможность моделирования динамики ареалов видов на основе оценки связей с климатическими параметрами, геосистемными характеристиками и структурой основных местообитаний [41]. Ряд моделей также охватывает особенности распространения видов в зависимости от условий природопользования и инвазионных характеристик [42]. Использование моделирования позволяет лучше понять биологию изучаемого вида [43], закономерности биоразнообразия и механизмы сосуществования видов [44], определить стратегию и проводить планирование природоохранных мероприятий [45], оценить изменения экологических условий произрастания видов и различных таксономических групп [46]. Информативный обзор методологии, способов моделирования и аспектов использования моделей приведен в публикации Дж. Элит и Дж.Р. Лифвик [47]. Самые первые модели часто именовались моделями «климатических конвертов» (climatic envelops) и позволяли визуализировать экологическую нишу вида, основанную на климатических параметрах. В последующем модели стали структурно более сложными и появилась возможность сопоставлять доступные данные по местонахождению с различными экологическими переменными для дальнейшего моделирования географического распространения реализованных экологических ниш видов. Для таких моделей наиболее широко используется термин «модель распространения видов» (Species Distribution Model) (табл. 1). В современных публикациях отмечается, что более приемлемым следует считать термин «модель пригодности местообитания» (Habitat Suitability Model) [48]. Таблица 1 [Table 1] Число публикаций в реферативных базах данных с использованием методов моделирования пространственного распределения видов [Number of publications in databases using modeling of spatial species distribution] Термин на английском [Term in English] Русскоязычный эквивалент [Equivalent in Russian] Число статей в базе Web of Science* [Number of papers in WoS database] Число статей в базе Scopus* [Number of papers in Scopus database] Species distribution model Модель распространения вида 1020 3144 Ecological niche model Модель экологической ниши 299 906 Habitat suitability model Модель пригодности местообитания 248 552 Environmental niche model Модель экологической ниши 31 116 Species niche model Модель ниши вида 5 19 * Представлен^! данные за последние 10 лет (с 2009 по 2018 г.), дата обращения: 13.02.2019. [Data are presented for the last 10 years (from 2009 to 2018), accessed at 13.02.2019.] Современные подходы к моделированию разнообразия видов растений 87 Проведенный поиск устойчивых словосочетаний, обозначающих методы пространственного моделирования распределения видов и исследования экологической ниши, в реферативных базах данных за последние 10 лет выявил, что доля публикаций российских ученых по всем направлениям составляет 10000 км [Global] Континентальный 200010000 км [Continental] Региональный 2002000 км [Regional] Ланд-шаф-тный 10-200 км [Landscape] Локальный 1-10 км [Local] Сайт 101000 м [Site] Микро-сайт

Ключевые слова

databases, species distribution modeling, species richness, latitudinal diversity gradient, plant geography, базы данных, видовое богатство, моделирование распространения видов, широтный градиент разнообразия, география растений

Авторы

ФИООрганизацияДополнительноE-mail
Санданов Денис ВикторовичИнститут общей и экспериментальной биологии СО РАНканд. биол. наук, с.н.с. лаборатории флористики и геоботаники Федерального государственного бюджетного учреждения науки; ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-8504-3485sdenis1178@mail.ru
Всего: 1

Ссылки

Sandanov D.V., Pisarenko O.Yu. Bioclimatic modeling of Crossidium squamiferum (Viv.) Jur. (Pottiaceae, Bryophyta) distribution // Arctoa. 2018. Vol. 27. P. 29-34.
Гудкова П.Д., Олонова М.В., Феоктистов Д.С. Сравнение эколого-климатических ниш двух видов ковылей - Stipa sareptana A.K. Becker и S. krylovii Roshev. (Poaceae) // Ukrainian Journal of Ecology. 2017. Т. 7 (4). С. 263-269.
Солодянкина С.В., Истомина Е.А., Сороковой А.А., Чепинога В.В. Моделирование потенциального ареала ветреницы байкальской (Anemone baicalensis, Ranunculaceae) в Байкальском регионе // География и природные ресурсы. 2016. № 5. С. 92-99.
Дудов С.В. Моделирование распространения видов по данным рельефа и дистанционного зондирования на примере сосудистых растений нижнего горного пояса хр. Тукурингра (Зейский заповедник, Амурская область) // Журнал общей биологии. 2016. Т. 77, № 2. С. 122-134.
Санданов Д.В., Найданов Б.Б. Пространственное моделирование ареалов восточноазиатских видов растений: современное состояние и динамика под влиянием климатических изменений // Растительный мир Азиатской России. 2015. № 3 (19). С. 30-35.
Korolyuk A.Yu., Zverev A.A. Database of Siberian Vegetation (DSV) // Biodiversity & Ecology. 2012. Vol. 4. P. 312.
Chepinoga VV Wetland vegetation database of Baikal Siberia (WETBS) // Biodiversity & Ecology. 2012. Vol. 4. P. 311.
Науменко Н.И. Флористическое районирование Южного Зауралья // Вестник Санкт-Петербургского университета. 2004. Сер. 3. № 1. С. 69-90.
Баранова О.Г. Сравнительный анализ локальных флор Вятско-Камского междуречья // Развитие сравнительной флористики в России: вклад школы А.И. Толмачева : материалы VI Рабочего совещания по сравнительной флористике / под ред. С.В. Дегтевой. Сыктывкар, 2004. С. 25-30.
Королева Т.М., Зверев А.А., Катенин А.Е., Петровский В.В., Поспелова Е.Б., Ребристая О.В., Секретарева Н.А., Ходачек Е.А., Хитун О.В., Чиненко С.В., Современные подходы к моделированию разнообразия видов растений 105 Юрцев Б.А. Долготная географическая структура локальных и региональных флор Азиатской Арктики // Ботанический журнал. 2008. Т. 93, № 2. С. 193-220.
Юрцев Б.А., Зверев А.А., Катенин А.Е., Королева Т.М., Петровский В.В., Ребристая О.В., Секретарева Н.А., Хитун О.В., Ходачек Е.А. Пространственная структура видового разнообразия локальных и региональных флор Азиатской Арктики // Ботанический журнал. 2004. Т. 89, № 11. С. 1689-1727.
Юрцев Б.А., Зверев А.А., Катенин А.Е., Королева Т.М., Кучеров И.Б., Петровский В.В., Ребристая О.В., Секретарева Н.А., Хитун О.В., Ходачек Е.А. Градиенты таксономических параметров локальных и региональных флор Азиатской Арктики (в сети пунктов мониторинга биоразнообразия) // Ботанический журнал. 2002. Т. 87, № 6. С. 1-28.
Liu Y., Su X., Shrestha N., Wang S., Xu X., Li Y., Wang Q., Sandanov D., Wang Z. Effects of contemporary environment and Quaternary climate change on dryland plant diversity differ between growth forms // Ecography. 2019. Vol. 42. PP. 334-345.
Su X., Wang Z., Sandanov D.V. Tropical niche conservatism and glacial-interglacial climate change shaped woody plant diversity in eastern Asia // Macroecology in Space and Time: 10th Annual Meeting of the Specialist Group on Macroecology of the Ecological Society of Germany, Austria, and Switzerland. Vienna, 2017. P. 17.
Araujo M.B., Nogues-Bravo D., Diniz-Filho J.A.F., Haywood A.M., Valdes P. J., Rahbek C. Quaternary climate changes explain diversity among reptiles and amphibians // Ecography. 2008. Vol. 31, № 1. PP. 8-15.
Venevsky S., Venevskaia I. Hierarchical systematic conservation planning at the national level: Identifying national biodiversity hotspots using abiotic factors in Russia // Biological Conservation. 2005. Vol. 124. PP. 235-251.
Коропачинский И.Ю., Встовская Т.Н. Древесные растения Азиатской России. Новосибирск : Гео, 2002. 707 с.
Санданов Д.В., Wang Z., Su X. База данных по распространению древесных растений Восточной Евразии: возможности и перспективы // Проблемы изучения и сохранения растительного мира Евразии : материалы II Всерос. конф. с участием иностранных ученых. Иркутск, 2017. С. 179-181.
Флора Путорана (Материалы к познанию особенностей состава и генезиса горных субарктических флор Сибири). Новосибирск : Наука, 1976. 245 с.
Серегин А.П. Сеточное картирование флоры: мировой опыт и современные тенденции // Вестник Тверского государственного университета. Сер. Биология и экология. 2013. Вып. 32. С. 210-245.
Дудов С.В., Дудова К.В., Гамова Н.С. Исследование ботанико-географических рубежей в российской части бассейна р. Амур путем моделирования пространственного распространения видов сосудистых растений // Использование современных информационных технологий в ботанических исследованиях : тезисы докл. междунар. науч.-практ. конф. / под ред. Е.А. Боровичева, Д.А. Давыдова, Н.Е. Королевой. Апатиты, 2017. С. 41-44.
Серегин А.П. Цифровой гербарий МГУ - крупнейшая российская база данных по биоразнообразию // Известия академии наук. Серия биологическая. 2017. № 6. С. 610-616.
Morozova O.V. East Asian species in alien flora of European Russia // Botanica Pacifica. 2014. Vol. 3, № 1. PP. 21-31.
Морозова О.В., Борисов М.М. Веб-ориентированная геоинформационная система по чужеродным видам растений Европейской России // Российский журнал биологических инвазий. 2010. Т. 3, № 2. С. 47-55.
Морозова О.В. База данных по адвентивным видам растений (Alien plant species) // Материалы совещания по экологической безопасности России. М. : IUCN, 2002. C. 83-94.
Афонин А.Н., Грин С.Л., Дзюбенко Н.И., Фролов А.Н. (ред.) Агроэкологический атлас России и сопредельных стран: экономически значимые растения, их вредители, болезни и сорные растения [DVD-версия]. 2008. URL: http://www.agroatlas.ru
Ареалы деревьев и кустарников СССР / С.Я. Соколов, О.А. Связева, В.А. Кубли ; под ред. В.И. Грубова. Л. : Наука, 1986. 182 с.
Ареалы деревьев и кустарников СССР / С.Я. Соколов, О.А. Связева, В.А. Кубли ; под ред. В.И. Грубова. Л. : Наука, 1980. 144 с.
Атлас ареалов и ресурсов лекарственных растений СССР / под ред. П.С. Чикова. М.: Картография, 1983. 340 с.
Ареалы деревьев и кустарников СССР / С.Я. Соколов, О.А. Связева, В.А. Кубли ; под ред. В.И. Грубова. Л. : Наука, 1977. 164 с.
Ареалы растений флоры СССР / под ред. А.И. Толмачева. Л. : Изд-во Ленингр. ун-та, 1976. Вып. 3. 176 с.
Ареалы растений флоры СССР / под ред. А.И. Толмачева. Л. : Изд-во Ленингр. ун-та, 1965. 191 с.
Ареалы растений флоры СССР / под ред. А.И. Толмачева. Л.: Изд-во Ленингр. ун-та, 1969. Вып. 2. 248 с.
Чепинога В.В., Петухин В.А., Стальмакова Д.П. Результаты сеточного картирования сводки «Флора Центральной Сибири» (1979) в цифровом формате: итоги и перспективы использования // Растительный мир Азиатской России. 2017. № 3 (27). С. 70-78.
Толмачев А.И. Введение в географию растений. Л. : Изд-во Ленингр. ун-та, 1974. 244 с.
Толмачев А.И. От редактора // Ареалы растений флоры СССР. Л. : Изд-во Ленингр. унта, 1965. С. 3-8.
Shcheglovitova M., Anderson R.P. Estimating optimal complexity for ecological niche models: A jackknife approach for species with small sample sizes // Ecological Modelling. 2013. Vol. 269. PP. 9-17.
Breiner F.T., Nobis M.P., Bergamini A., Guisan A. Optimizing ensembles of small models for predicting the distribution of species with few occurrences // Methods in Ecology and Evolution. 2017. Vol. 9, № 4. PP. 802-808.
Chapman D.S. Weak climatic associations among British plant distributions // Global Ecology and Biogeography. 2010. Vol. 19. PP. 831-841.
Segurado P., Araujo M.B., Kunin W.E. Consequences of spatial autocorrelation for nichebased models // Journal of Applied Ecology. 2006. Vol. 43. PP. 433-444.
Афонин А.Н., Соколова Ю.В. Эколого-географический анализ и моделирование распространения биологических объектов с использованием ГИС. СПб. : Изд-во ВВМ, 2018. 121 с.
Олонова М.В., Гудкова П.Д. Биоклиматическое моделирование: задания для практической работы и методические указания к их выполнению. Томск : Издательский дом ТГУ, 2017. 50 с.
Thuiller W., Lafourcade B., Engler R., Araujo M.B. BIOMOD - a platform for ensemble forecasting of species distributions // Ecography. 2009. Vol. 32. P. 369-373.
Broennimann O., Di Cola V., Petitpierre B., Breiner F., Scherrer D., Manuela D., Randin C., Engler R., Hordijk W., Mod H., Pottier J., Di Febbraro M., Pellissier L., Pio D., Mateo R.G., Dubuis A., Maiorano L., Psomas A., Ndiribe C., Salamin N., Zimmermann N., Guisan A. Package ‘ecospat'. June 27, 2018 http://mirrors.nic.cz/R/web/packages/ecospat/ecospat.pdf
Олонова М.В., Gao X. Потенциальные возможности распространения адвентивного растения Poa compressa L. в Сибири // Вестник Томского государственного университета. Биология. 2014. № 4 (28). С. 56-69.
Пузаченко Ю.Г., Желтухин А.С., Сандлерский Р.Б. Анализ пространственновременной динамики экологической ниши на примере популяции лесной куницы (Martes martes) // Журнал общей биологии. 2010. Т. 71, № 6. С. 467-487.
Zizka A., Silvestro D., Andermann T., Azevedo J., Ritter C.D., Edler D., Farooq H., Herdean A., Ariza M., Scharn R., Svanteson S., Wengstrom N., Zizka V., Antonelli A. CoordinateCleaner: standardized cleaning of occurrence records from biological collection databases // Methods in Ecology and Evolution. 2019. Vol. 10. PP. 744-751. https://doi. org/10.1111/2041-210X.13152 Современные подходы к моделированию разнообразия видов растений 103
Brown J.L., Bennett J.R., French C.M. SDMtoolbox 2.0: the next generation Python-based GIS toolkit for landscape genetic, biogeographic and species distribution model analyses // PeerJ. 2017. 5, e4095. https://doi.org/10.7717/peerj.4095
Serra-Diaz J.M., Enquist B.J., Maitner B., Merow C., Svenning J.-C. Big data of tree species distributions: how big and how good? // Forest Ecosystems. 2017. 4:30. https://doi. org/10.1186/s40663-017-0120-0
Velazco S.J.E., Galvao F., Villalobos F., De Marco Junoir P. Using worldwide edaphic data to model plant species niches: An assessment at a continental extent // PLoS ONE. 2017. 12(10): e0186025. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0186025
Rohr R.P., Naisbit R.E., Massa C., Bersier L.-F. Matching-centrality decomposition and the forecasting of new links in networks // Proceedings of the Royal Society B. Biological Sciences. 2016. Vol. 283. PP. 20152702.
Pellissier L., Niculita-Hirzel H., Dubuis A., Pagni M., Guez N., Ndiribe C., Salamin N., Xenarios I., Goudet J., Sanders I.R., Guisan A. Soil fungal communities of grasslands are environmentally structured at a regional scale in the Alps // Molecular Ecology. 2014. Vol. 23. PP. 4274-4290.
Le Roux P.C., Pellissier L., Witz M.S., Luoto M. Incorporating dominant species as proxies for biotic interactions strengthens plant community models // Journal of Ecology. 2014. Vol. 102. PP. 767-775.
Wisz M.S., Pottier J., Kissling W.D., Pellissier L.and all The role of biotic interactions in shaping distributions and realised assemblages of species: implications for species distribution modeling // Biological Reviews. 2013. Vol. 88. PP. 15-30.
Buisson L., Thuiller W., Casajus N., Lek S., Grenouillet G. Uncertainty in ensemble forecasting of species distribution // Global Change Biology. 2010. Vol. 16. PP. 1145-1157.
Wang T., Campbell E.M., O'Neill G.A., Aitken S.N. Projecting future distributions of ecosystem climate niches: uncertainties and management applications // Forest Ecology and Management. 2012. Vol. 279. PP. 128-140.
Thuiller W., Albert C., Araujo M.B., Berry P.M., Cabeza M., Guisan A., Hickler T., Midgely G.F., Paterson J., Schurr F.M., Sykes M.T., Zimmermann N.E. Predicting global change impacts on plant species' distributions: Future challenges // Perspectives in Plant Ecology Evolution and Systematics. 2008. Vol. 9. PP. 137-152.
Araujo M.B., Guisan A. Five (or so) challenges for species distribution modelling // Journal of Biogeography. 2006. Vol. 33. PP. 1677-1688.
Guisan A., Thuiller W., Zimmermann N.E. Habitat suitability and distribution models: with application in R. Cambridge: Cambridge University Press, 2017. doi: 10.1017/9781139028271
Elith J., Leathwick J.R. Species distribution models: Ecological explanation and prediction across space and time // Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics. 2009. Vol. 40. PP. 677-697.
Thuiller W., Pironon S., Psomas A., Barbet-Massin M., Jiguet F., Lavergne S., Pearman P.B., Renaud J., Zupan L., Zimmermann N.E. The European functional tree of bird life in the face of global change // Nature Communications. 2014. Vol. 5, № 3118.
Kremen C., Cameron A., Moilanen A., Philips S.J., Thomas C.D., Beentje H., Dransfield J., Fischer B.L., Glaw F., Good T.C., Harper G.J., Hijmans R.J., Lees D.C., Louis Jr. E., Nussbaum R.A., Raxworthy C.J., Razafimpahanana A., Schatz G.E., Vences M.,Vieites D.R., Wright P.C., Zjhra M.L. Aligning conservation priorities across taxa in Madagascar with high-resolution planning tools // Science. 2008. Vol. 320. PP. 222-226.
Thuiller W., Pollock L.J., Gueguen M., Munkemuller T. From species distributions to metacommunities // Ecology Letters. 2015. Vol. 18. PP. 1321-1328.
Meier E.S., Edwards Jr T.C., Kienast F., Dobbertin M., Zimmermann N.E. Co-occurrence patterns of tress along macro-climatic gradients and their potential influence on the present and future distribution of Fagus sylvatica L. // Journal of Biogeography. 2011. Vol. 38. PP. 371-382.
Guisan A., Thuiller W. Predicting species distribution: offering more than simple habitat models // Ecological Letters. 2005. Vol. 8. PP. 993-1009.
Guisan A., Zimmermann N.E. Predictive habitat distribution models in ecology // Ecological Modelling. 2000. Vol. 135. PP. 147-186.
Kinlock N.L., Prowant L., Herstoff E.M., Foley C.M., Akin-Fajiye M., Bender N., Umarani M., Ryu H.Y., Sen B., Gurevich J. Explaining global variation in the latitudinal diversity gradient: Meta-analysis confirms known patterns and uncovers new ones // Global Ecology and Biogeography. 2018. Vol. 27. PP. 125-141.
Ширяев А.Г. Широтные изменения разнообразия грибов на модельной трансекте Евразии // Известия Российской академии наук. Серия географическая. 2018. № 3. С. 56-66.
Gaucherel C., Tramier C., Devictor V, Svenning J.-C., Hely C. Where and at which scales does the latitudinal diversity gradient fail? // Journal of Biogeography. 2018. Vol. 45. PP. 1905-1916.
Chen S.-B., Ferry Slik J.W., Gao J., Mao L.-F., Bi M.-J., Shen M.-W., Zhou K.-X. Latitudinal diversity gradients in bryophytes and woody plants: Roles of temperature and water availability // Journal of Systematics and Evolution. 2015. Vol. 53, № 6. PP. 535-545.
Svenning J.-C., Skov F. The relative roles of environment and history as controls of tree species composition and richness in Europe // Journal of Biogeography. 2005. Vol. 32. PP. 1019-1033.
Ricklefs R.E. Evolutionary diversification and the origin of the diversity-environment relationship // Ecology. 2006. Vol. 87. PP. S3-S13.
Kerkoff A.J., Moriarty P.E., Weiser M.D. The latitudinal species richness gradient in New World woody angiosperms is consistent with the tropical conservatism hypothesis // Proceedings of the National Academy of Sciences. 2014. Vol. 111. PP. 8125-8130.
Mittelbach G.G., Schemske D.W., Cornell H.V., Allen A.P., Brown J.M., Bush M.B., Harrison S.P., Hurlbert A.H., Knowlton N., Lessios H.A., McCain C.M., McCune A.R., McDade L.A., McPeek M.A., Near T.J., Price T.D., Ricklefs R.E., Roy K., Sax D.F., Schluter D., Sobel J.M., Turelli M. Evolution and the latitudinal diversity gradient: Speciation, extinction and biogeography // Ecology Letters. 2007. Vol. 10. PP. 315-331.
Qian H., Ricklefs R.E. Large-scale processes and the Asian bias in species diversity of temperate plants // Nature. 2000. Vol. 407. PP. 180-182.
Shiono T., Kusumoto B., Yasuhara M., Kubota Y. Roles of climate niche conservatism and range dynamics in woody plant diversity patterns through the Cenozoic // Global Ecology and Biogeography. 2018. Vol. 27. PP. 865-874.
Wang S., Xu X., Shrestha N., Zimmermann N.E., Tang Z., Wang Z. Response of spatial vegetation distribution in China to climate changes since the Last Glacial Maximum (LGM) // PLoS ONE. 2017. 12 (4): e0175742. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0175742
Zanne A.E., Tank D.C., Cornwell W.K., and all Three keys to the radiation of angiosperms into freezing environments // Nature. 2014. Vol. 506. PP. 89-92.
Jansson R., Dynesius M. The fate of clades in a world of recurrent climatic change: Milankovitch oscillations and evolution // Annual Review of Ecology and Systematics. 2002. Vol. 33. PP. 741-777.
Donoghue M.J. Colloquium paper: a phylogenetic perspective on the distribution of plant diversity // Proceedings of National Academy of Sciences. 2008. Vol. 105. Suppl. 1. PP. 11549-11555.
Latham R.E., Ricklefs R.E. Global patterns of tree species richness in moist forests: Energydiversity theory does not account for variation in species richness // Oikos. 1993. Vol. 67. PP. 325-333.
Giehl E.L.H., Jarenkow J.A. Niche conservatism and the differences in species richness at the transition of tropical and subtropical climates in South America // Ecography. 2012. Vol. 35. PP. 933-943.
Wiens J.J., Ackerly D.D., Allen A.P., Anacker B.L., Buckley L.B., Cornell H.V., Damschen E.I., Jonathan D.T., Grytnes J.A., Harrison S.P., Hawkins B.A., Holt R.D., McCain C.M., Stephens P.R. Niche conservatism as an emerging principle in ecology and conservation biology // Ecology Letters. 2010. Vol. 13. PP. 1310-1324.
Wiens J.J., Donoghue M.J. Historical biogeography, ecology and species richness // Trends in Ecology & Evolution. 2004. Vol. 19. PP. 639-644.
Малышев Л.И. Количественный анализ флоры: пространственное разнообразие, уровень видового богатства и репрезентативность участков обследования // Ботанический журнал. 1975. Т. 60, № 11. С. 1537-1550.
Водопьянова Н.С. Зональность флоры Среднесибирского плоскогорья. Новосибирск : Наука, 1984. 156 с.
Морозова О.В. Таксономическое богатство флоры Восточной Европы: факторы пространственной дифференциации. М. : Наука, 2008. 328 с.
Шмидт В.М. Зависимость количественных показателей конкретных флор европейской части СССР от географической широты // Ботанический журнал. 1979. Т. 64, № 2. C. 172-183.
Hawkins B.A. Ecology's oldest pattern? // Trends in Ecology & Evolution. 2001. Vol. 16, № 8. P. 470.
Вульф Е.В. Опыт деления земного шара на растительные области на основе количественного распределения видов // Труды ВАСХНиЛ. 1934. Сер. 1, № 2. С. 3-40.
Морозова О.В. Пространственные тренды таксономического богатства флоры сосудистых растений // Биосфера. 2011. Т. 3, № 2. С. 190-207.
Wang Z., Fang J., Tang Z., Lin X. Patterns, determinants and models of woody plant diversity in China // Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 2011. Vol. 278. PP. 2122-2132.
Marsh S.T., Brummitt N.A., de Kok R.P.J., Utteridge T.M.A. Large-scale patterns of plant diversity and conservation priorities in South East Asia // Blumea. 2009. Vol. 54. PP. 103108.
Kreft H., Jetz W. Global patterns and determinants of vascular plant diversity // Proceedings of the National Academy of Sciences. 2007. Vol. 104. PP. 5925-5930.
Mutke J., Barthlott W. Patterns of vascular plant diversity at continental to global scales // Biologiske Skrifter. 2005. Vol. 55. PP. 521-531.
Hof C., Levinsky I., Araujo M.B., Rahbek C. Rethinking species' ability to cope with rapid climate change // Global Change Biology. 2011. Vol. 17. PP. 2987-2990.
Loarie S.R., Duffy P.B., Hamilton H., Asner G.P., Field C.B., Ackerly D.D. The velocity of climate change // Nature. 2009. Vol. 462. PP. 1052-1055.
Currie D.J. Energy and large-scale patterns of animal- and plant-species richness // The American Naturalist. 1991. Vol. 137. PP. 27-49
Svenning J.C., Skov F. Ice age legacies in the geographical distribution of tree species richness in Europe // Global Ecology and Biogeography. 2007. Vol. 16. PP. 234-245.
Colwell R.K., Lees D.C. The mid-domain effect: Geometric constraints on the geography of species richness // Trends in Ecology & Evolution. 2000. Vol. 15. PP. 70-76
Stein A., Gerstner K., Kreft H. Environmental heterogeneity as a universal driver of species richness across taxa, biomes and spatial scales // Ecology Letters. 2014. Vol. 17. PP. 866-880
Sandel B., Arge L., Dalsgaard B., Davies R.G., Gaston K.J., Sutherland W.J., Svenning J.C. The influence of Late Quaternary climate-change velocity on species endemism // Science. 2011. Vol. 334. PP. 660-664
Currie D.J., Paquin V. Large-scale biogeographical patterns of species richness of trees // Nature. 1987. Vol. 329. PP. 326-327
Field R., Hawkins B.A., Cornell H.V., Currie D.J., Diniz-Filho J.A.F., Guegan J.-F., Kaufman D.M., Kerr J.T., Mittelbach G.G., Oberdorff T., O'Brien E.M., Turner J.R.G. Spatial species-richness gradients across scales: a meta-analysis // Journal of Biogeography. 2009. Vol. 36. PP. 132-147
Montoya D., Rodriguez M.A., Zavala M.A., Hawkins B.A. Contemporary richness of holarctic trees and the historical pattern of glacial retreat // Ecography. 2007. Vol. 30. PP. 173-182
Brown J.H., Lomolino M.V. Biogeography. Sunderland, Massachusetts : Sinauer Associates, Inc., 1998. 2nd edition. 691 p
 Современные подходы к моделированию разнообразия и пространственному распределению видов растений: перспективы их применения в России | Вестник Томского государственного университета. Биология. 2019. №  46. DOI: 10.17223/19988591/46/5

Современные подходы к моделированию разнообразия и пространственному распределению видов растений: перспективы их применения в России | Вестник Томского государственного университета. Биология. 2019. № 46. DOI: 10.17223/19988591/46/5