Изучение продуктов жизнедеятельности сельскохозяйственных животных: перспективы создания биобанка
Коллекционирование образцов, ассоциированных с сельскохозяйственными животными, представляет значительный научный и практический интерес. Проведение экспериментальных работ с использованием биологического материала, собранного и сохраненного в ходе широкомасштабных исследований, в том числе с привлечением возможностей гражданской науки, позволяет не только выявить параметры, характеризующие особенности физиологии животных, но и обнаружить новые виды микроорганизмов, перспективные для биотехнологий. Подход к процессу отбора проб требует особого внимания, поскольку качество отбираемого биологического материала играет решающую роль в исследовательском процессе. При этом методы и подходы гражданской науки позволяют значительно расширить территориально-географический охват мест отбора проб, что позволит увеличить достоверность получаемых научных данных. Биобанк выступает связующим звеном взаимодействия в контексте сопряжения профессиональных исследований и «гражданской науки», организует и координирует процесс. В статье приведен опыт организации биобанка НИ ТГУ, деятельность которого направлена на сохранение образцов продуктов жизнедеятельность сельскохозяйственно значимых животных (навоз, помет, компост, а также образцы кисломолочных продуктов). Кроме того, объектами хранения биобанка являются штаммы сельскохозяйственно значимых микроорганизмов, выделенных в ходе исследований собранного биологического материала. Биобанк выступает как уникальная в своем роде структура, «универсальный инструмент», созданный для реализации крупномасштабных научных проектов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Ключевые слова
гражданская наука,
сельскохозяйственно значимые микроорганизмы,
продукты жизнедеятельности сельскохозяйственно значимых животных,
биологические образцы,
биобанк,
биоресурсная коллекцияАвторы
| Ковтун Ирина Сергеевна | Томский государственный университет | м.н.с. лаборатории биохимии и молекулярной биологии | kovtunirina2@gmail.com |
| Филонова Мария Васильевна | Томский государственный университет | канд. биол. наук, доцент кафедры физиологии растений, биотехнологии и биоинформатики | Maria-Caurus7@yandex.ru |
| Борисова Анна Александровна | Национальный исследовательский центр Курчатовский институт | лаборант-исследователь | AnnAlexBorisova@yandex.ru |
| Сазонов Алексей Эдуардович | Томский государственный университет | советник при ректорате | sazonov_al@mail.ru |
Всего: 4
Ссылки
Encarnacao J., Teodosio M.A., Morais P. Citizen science and biological invasions: a review // Frontiers in Environmental Science. 2021. Vol. 8 (602980). PP. 1-13.>
Kerckhof F.M., Courtens E.N., Geirnaert A. Optimized cryopreservation of mixed microbial communities for conserved functionality and diversity // PLoS One. 2014. № 9 (6). PP. e99517.>
Hoefman S., Van H.K., Boon N. et al. Survival or Revival: Long-Term Preservation Induces a Reversible Viable but Non-Culturable State in Methane-Oxidizing Bacteria // PLoS ONE. № 7 (4). PP. e34196.>
Vekeman B., Heylen K. Preservation of Microbial Pure Cultures and Mixed Communities // Hydrocarbon and Lipid Microbiology Protocols: Isolation and Cultivation. 1 ed / eds. by T.J. McGenity, K.N. Timmis, B. Nogales. Berlin: Springer-Verlag, 2015. PP. 299315.>
Chen S., Luo S., Yan C. Gut Microbiota Implications for Health and Welfare in Farm Animals: A Review // Animals (Basel). 2021. № 12 (1). PP. 93.>
Wegl G., Grabner N., Kostelbauer A. et al. Toward Best Practice in Livestock Microbiota Research: A Comprehensive Comparison of Sample Storage and DNA Extraction Strategies // Frontiers in Microbiology. 2021. № 12. PP. 627539.>
Макаров В.В. Факторные болезни: так что же это такое? // Ветеринарный консультант. 2008. № 6. С. 3-7.>
Bahrndorff S., Alemu T., Alemneh T., Lund Nielsen J. The Microbiome of Animals: Implications for Conservation Biology // International Journal of Genomics. 2016. № 2016. PP. 5304028. 10.1155 /2016/5304028.>
Caenazzo L., Tozzo P. Microbiome Forensic Biobanking: A Step toward Microbial Profiling for Forensic Human Identification // Healthcare (Basel). 2021. № 9 (10). PP. 1371.>
Berg G., Rybakova D., Fischer D. et al. Microbiome definition re-visited: old concepts and new challenges // Microbiome. 2020. № 8. PP. 103.>
Prakash O., Nimonkar Y., Desai D. A Recent Overview of Microbes and Microbiome Preservation // Indian Journal of Microbiology. 2020. № 60 (3). PP. 297-309.>
Jin Song S., Woodhams D.C., Martino C. Engineering the microbiome for animal health and conservation // Experimental Biology and Medicine. 2019. № 7244 (6). PP. 494-504.>
Ryan M.J., Schloter M., Berg G. Development of Microbiome Biobanks - Challenges and Opportunities // Trends in Microbiology. 2021. № 29 (2). PP. 89-92.>
Jarett J.K., Kingsbury D.D., Dahlhausen K.E. et al. Best practices for Microbiome study design in companion animal research // Frontiers in Veterinary Science. 2021. № 8. PP. 644836.>
Read S., Marzorati M., Guimaraes B.C.M. Microbial resource management revisited: successful parameters and new concepts // Applied Microbiology and Biotechnology. 2011. № 90. PP. 861-871.>
Bolan S., Seshadri B., Talley N.J., Naidu R. Bio-banking gut microbiome samples // EM-BO reports. 2016. № 17 (7). PP. 929-930.>
Groeneveld L.F., Gregusson S., Guldbrandtsen B. Domesticated Animal Biobanking: Land of Opportunity // PLoS Biol. 2016. № 14 (7). PP. e1002523.>
Долудин Ю.В., Борисова А.Л., Покровская М.С. и др. Современные передовые практики и рекомендации по биобанкированию // Клиническая лабораторная диагностика. 2019. № 64 (12). С. 769-776.>
Paskal W., Paskal A.M., Debski T. et al. Aspects of modern biobank activity - comprehensive review // Pathology & Oncology Research. 2018. № 24 (4). PP. 771-785.>
Lopez A., Sassone A.B. The uses of herbaria in botanical research // Frontiers in Plant Science. 2019. № 10 (1363). PP. 1-10.>
Брызгалина Е.В., Аласания К.Ю., Садовничий В.А. Социально-гуманитарная экспертиза функционирования национальных депозитариев биоматериалов // Вопросы философии. 2016. № 2. С. 18-21.>
Каменский П.А., Сазонов А.Э., Федянин А.А., Садовничий В.А. Биологические коллекции: стремление к идеалу // Acta natura. 2016. № 8 (2). С. 6-10.>
Вы можете добавить статью